Certyfikacja BREEAM odbywa się najczęściej dwuetapowo: najpierw oceniamy budynek na etapie projektowania (Design Stage), czego wynikiem jest tak zwany BREEAM Interim Certificate, a następnie na etapie zakończenia inwestycji (Post-Construction Stage), po którym otrzymuje się Final BREEAM Certificate. System BREEAM składa się z 10 głównych kategorii, w obrębie których znajduje się kilkadziesiąt podkategorii. Główne kategorie to: